MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus VC40 chromosome

Total Repeats: 64436

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016912	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016912	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016912	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016912	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016912	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016912	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016912	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016912	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016912	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016912	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016912	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
12	NC_016912	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013366
13	NC_016912	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013366
14	NC_016912	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013366
15	NC_016912	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
16	NC_016912	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013366
17	NC_016912	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013366
18	NC_016912	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013366
19	NC_016912	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	379013366
20	NC_016912	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
21	NC_016912	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	379013366
22	NC_016912	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013366
23	NC_016912	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013366
24	NC_016912	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
25	NC_016912	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
26	NC_016912	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013366
27	NC_016912	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
28	NC_016912	ACC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013366
29	NC_016912	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
30	NC_016912	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013366
31	NC_016912	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013366
32	NC_016912	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
33	NC_016912	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
34	NC_016912	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013366
35	NC_016912	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	379013366
36	NC_016912	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	379013366
37	NC_016912	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013366
38	NC_016912	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013366
39	NC_016912	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	379013366
40	NC_016912	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	379013366
41	NC_016912	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	379013366
42	NC_016912	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
43	NC_016912	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013366
44	NC_016912	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	379013366
45	NC_016912	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	379013366
46	NC_016912	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
47	NC_016912	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013366
48	NC_016912	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016912	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016912	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016912	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_016912	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016912	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016912	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016912	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	379013367
56	NC_016912	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
57	NC_016912	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
58	NC_016912	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013367
59	NC_016912	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013367
60	NC_016912	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013367
61	NC_016912	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	379013367
62	NC_016912	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	379013367
63	NC_016912	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	379013367
64	NC_016912	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
65	NC_016912	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	379013367
66	NC_016912	CAAA	2	8	2600	2607	75 %	0 %	0 %	25 %	379013367
67	NC_016912	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	379013367
68	NC_016912	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013367
69	NC_016912	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013367
70	NC_016912	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	379013367
71	NC_016912	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013367
72	NC_016912	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013367
73	NC_016912	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	379013367
74	NC_016912	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
75	NC_016912	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013367
76	NC_016912	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	379013367
77	NC_016912	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
78	NC_016912	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013367
79	NC_016912	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013367
80	NC_016912	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013367
81	NC_016912	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013367
82	NC_016912	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013367
83	NC_016912	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013367
84	NC_016912	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013367
85	NC_016912	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	379013367
86	NC_016912	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	379013367
87	NC_016912	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	379013367
88	NC_016912	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013367
89	NC_016912	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013367
90	NC_016912	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013367
91	NC_016912	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013367
92	NC_016912	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	379013367
93	NC_016912	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016912	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016912	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016912	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016912	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016912	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016912	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016912	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016912	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016912	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016912	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016912	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016912	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013368
106	NC_016912	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013368
107	NC_016912	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013368
108	NC_016912	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013368
109	NC_016912	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013368
110	NC_016912	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	379013368
111	NC_016912	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	379013368
112	NC_016912	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	379013368
113	NC_016912	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013369
114	NC_016912	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	379013369
115	NC_016912	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013369
116	NC_016912	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	379013369
117	NC_016912	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013369
118	NC_016912	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	379013369
119	NC_016912	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013369
120	NC_016912	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013369
121	NC_016912	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013369
122	NC_016912	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	379013369
123	NC_016912	CAG	2	6	4458	4463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013369
124	NC_016912	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013369
125	NC_016912	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013369
126	NC_016912	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013369
127	NC_016912	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013369
128	NC_016912	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013369
129	NC_016912	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013369
130	NC_016912	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013369
131	NC_016912	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013369
132	NC_016912	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013370
133	NC_016912	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	379013370
134	NC_016912	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	379013370
135	NC_016912	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013370
136	NC_016912	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	379013370
137	NC_016912	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013370
138	NC_016912	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	379013370
139	NC_016912	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013370
140	NC_016912	TGGCGG	2	12	5369	5380	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	379013370
141	NC_016912	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013370
142	NC_016912	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013370
143	NC_016912	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	379013370
144	NC_016912	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013370
145	NC_016912	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	379013370
146	NC_016912	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
147	NC_016912	CAG	2	6	5619	5624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013370
148	NC_016912	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	379013370
149	NC_016912	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013370
150	NC_016912	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
151	NC_016912	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013370
152	NC_016912	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	379013370
153	NC_016912	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013370
154	NC_016912	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013370
155	NC_016912	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
156	NC_016912	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	379013370
157	NC_016912	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013370
158	NC_016912	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013370
159	NC_016912	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	379013370
160	NC_016912	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013370
161	NC_016912	A	6	6	6222	6227	100 %	0 %	0 %	0 %	379013370
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163	NC_016912	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
164	NC_016912	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	379013370
165	NC_016912	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	379013370
166	NC_016912	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	379013370
167	NC_016912	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013370
168	NC_016912	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013370
169	NC_016912	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013370
170	NC_016912	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	379013370
171	NC_016912	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	379013370
172	NC_016912	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013370
173	NC_016912	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	379013370
174	NC_016912	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_016912	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_016912	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	379013371
177	NC_016912	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	379013371
178	NC_016912	A	6	6	7197	7202	100 %	0 %	0 %	0 %	379013371
179	NC_016912	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	379013371
180	NC_016912	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013371
181	NC_016912	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	379013371
182	NC_016912	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	379013371
183	NC_016912	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	379013371
184	NC_016912	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	379013371
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186	NC_016912	TTA	2	6	7503	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	379013371
187	NC_016912	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	379013371
188	NC_016912	CCA	2	6	7554	7559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	379013371
189	NC_016912	TAAG	2	8	7597	7604	50 %	25 %	25 %	0 %	379013371
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192	NC_016912	TTCAA	2	10	7721	7730	40 %	40 %	0 %	20 %	379013371
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194	NC_016912	TTG	2	6	7780	7785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013371
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206	NC_016912	CAGATA	2	12	8206	8217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	379013371
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251	NC_016912	A	6	6	9670	9675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_016912	TGG	2	6	9806	9811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	379013372
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257	NC_016912	ACA	2	6	10029	10034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	379013372
258	NC_016912	GGTGT	2	10	10123	10132	0 %	40 %	60 %	0 %	379013372
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263	NC_016912	TTG	2	6	10390	10395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	379013372
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267	NC_016912	TCT	2	6	10524	10529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	379013372
268	NC_016912	AT	3	6	10621	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_016912	TAT	2	6	10646	10651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_016912	ATT	3	9	10666	10674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_016912	ATT	2	6	10732	10737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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